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es el segundo Ángel . Aparece inicialmente como un gigantesco humanoide blanco sin piernas, cuya cara está cubierta por una máscara que muestra los Siete Ojos de Dios (y que se usa para el logotipo de SEELE). Muchas pequeñas piernas que parecen humanas surgen de muñones de su abdomen. Tiene la lanza de Longinus clavada en el pecho. Se le mantiene crucificada sobre una gran cruz en el Dogma Terminal, el nivel más bajo del cuartel general de NERV.Lilith, junto a la Luna Negra, fue creada para ser una "Semilla de Vida". Sus descendientes poseen el "Fruto del Conocimiento" la fuente de la ciencia y la tecnología humanas.
El torso de Lilith desprende constantemente LCL de la herida de salida de la Lanza de Longinus (mas no de la herida de entrada del arma), formando un lago de LCL bajo su cuerpo crucificado, del que se extrae el necesario para los Entry Plugs de los EVAs.
En el Primer Impacto, Lilith usurpó a Adán el puesto de progenitor de la vida en la Tierra. Toda la vida en la Tierra descendió de Lilith, aunque no se explica si es en sentido biológico o metafísico. Las "escenas borradas" del episodio 23, Rei III revelan que la unidad 01 deriva artificialmente de Lilith. Lilith fue descubierta en la Luna Negra, bajo Japón. Este lugar fue convertido en el cuartel general de NERV, el Geo-Frente, y el lugar donde estaba Lilith pasó a ser el Dogma Terminal. No se revela si fue encontrada crucificada o si fue puesta así más tarde.
En algún momento tras el experimento de contacto de Yui Ikari con el EVA-01, el alma de Lilith fue puesta en el cuerpo de Rei Ayanami. Más tarde, una vez recuperada, la lanza de Longinus fue usada para atravesarla, Rei Ayanami fue la encargada de eso. Cuando Ryōji Kaji reveló a Misato Katsuragi la existencia de Lilith, ambos asumieron que era Adán. Tabris fue el que más tarde la identificó correctamente como Lilith.
Lilith recibe su nombre de la primera mujer creada por Dios en la mitología judía