La segunda temporada toma lugar 3 años después de la primera. Durante este tiempo, Sora se vuelve más femenina y ahora aprende el arte de arreglos florales con su madre. Usa un sailor fuku. Ha cambiado el fútbol por el tenis y sigue ayudando a los demás Niños Elegidos siempre que puede. En Nochebuena, se comienza a observar cierto interés, amorosamente hablando, entre Sora y Yamato y en el concierto de navidad en el que la banda de Yamato debutará Sora debate con sigo misma si llevarle un paquete de galletas que ella misma hizo a Yamato quien se encuentra en su camerino,apoyada por Taichi Sora entta al camerino de Yamato para entregarle dicho regalo. Conforme avanza la serie hacia el final, se van viendo cada vez más imágenes en las que aparecen ambos (Sora y Yamato) claramente cojidos o abrazados.
